固相合成法简化并加速了合成步骤,合成反应都是在同一反应器中进行，可减少多次操作带来的原料损失。多肽连接在固相载体上，通过快速的抽滤、洗涤来清洗掉反应剩余原料，可控制单步反应效率，提高最终产品产率和纯度。 固相合成的缺点是固相载体上中间体杂肽很难分离，这样造成最终产物的纯度可能不如液相合成物，因此必需通过可靠的分离纯化方法（HPLC纯化）来解决纯度问题。